- تم عمل الفهارس الآتية:
١ - فهرس الأرباع.
٢ - القراءات المتواترة غير حفص.
٣ - القراءات الشاذة.
٤ - الأحاديث القولية.
٥ - الأحاديث الفعلية.
٦ - الآثار.
٧ - رجال الإسناد.
٨ - الأعلام المترجم لهم غير رجال الإسناد.
٩ - فهرس شيوخ المصنف.
١٠ - الفرق والأديان.
١١ - الشعر.
١٢ - الألفاظ المشروحة لغويًا.
١٣ - موضوعات القرآن الكريم (وهو مستفاد من كتاب: دليل الموضوعات في آيات القرآن الكريم).
١٤ - فهرس المصادر والمراجع.
١٥ - فهرس ترتيب الكتاب ببيان موضع بداية السور والأجزاء والأرباع.